Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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