Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl39Q9JKF7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Mrpl39Q9JKF7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms