Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms