Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ybx3Q9JKB3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ybx3Q9JKB3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms