Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms