Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1cc1Q9ESK9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms