Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smg9Q9DB90 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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