Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Erv3Q9DAX3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms