Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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