Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm3404Q9D506 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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