Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt20Q9D312 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms