Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pramef12Q9D2F1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pramef12Q9D2F1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms