Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syf2Q9D198 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms