Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gins3Q9CY94 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms