Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms