Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rprd1bQ9CSU0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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