Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nicn1Q9CQM0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms