Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rdm1Q9CQK3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rdm1Q9CQK3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdm1Q9CQK3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms