Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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