Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gtf2ird2Q99NI3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Gtf2ird2Q99NI3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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