Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NsmfQ99NF2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms