Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms