Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ufsp2Q99K23 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ufsp2Q99K23 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms