Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Higd1bQ99JY6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms