Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Smim11aQ99J19 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim11aQ99J19 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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