Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klc3Q91W40 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms