Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PpcsQ8VDG5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms