Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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