Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rab11fip5Q8R361 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 776.9 ms