Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lin28aQ8K3Y3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lin28aQ8K3Y3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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