Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Znf628Q8CJ78 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms