Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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