Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc9Q8CDN9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms