Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ubqln3Q8C5U9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln3Q8C5U9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ubqln3Q8C5U9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubqln3Q8C5U9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms