Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp38Q8BW70 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms