Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Slc5a7Q8BGY9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc5a7Q8BGY9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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