Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ChfrQ810L3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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ChfrQ810L3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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ChfrQ810L3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ChfrQ810L3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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