Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Npm2Q80W85 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms