Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcsk9Q80W65 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms