Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ell3Q80VR2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms