Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2q1Q7TSS2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms