Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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