Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vma21Q78T54 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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