Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Stambpl1Q76N33 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms