Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rbbp7Q60973 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbbp7Q60973 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms