Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sft2d1Q5SSN7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms