Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim41Q5NCC3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim41Q5NCC3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms