Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc1Q3UPH1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms