Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms