Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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